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二套房契税是避免不了的，是需要正常缴纳契税的，否则无法办理房产证。二套房缴纳契税的规定是购买非普通住房、二套及以上住房，以及商业投资性房产，如商铺、办公写字楼、商务公寓，均按照3%的税率征税。
第二套房契税税率是多少?第二套房契税税率是地方政府规定的，大多省份规定，家庭二套房90平米及以下契税税率为1%，90平米以上的契税税率为2%。家庭三套房及以上不论面积契税税率为3%。
《中华人民共和国契税暂行条例》
第三条 契税税率为3—5%。
契税的适用税率，由省、自治区、直辖市人民政府在前款规定的幅度内按照本地区的实际情况确定，并报财政部和国家税务总局备案。
第四条 契税的计税依据：
(一)国有土地使用权出让、土地使用权出售、房屋买卖，为成交价格;
(二)土地使用权赠与、房屋赠与，由征收机关参照土地使用权出售、房屋买卖的市场价格核定;
(三)土地使用权交换、房屋交换，为所交换的土地使用权、房屋的价格的差额。
前款成交价格明显低于市场价格并且无正当理由的，或者所交换土地使用权、房屋的价格的差额明显不合理并且无正当理由的，由征收机关参照市场价格核定。
二套房怎么认定二套房的认定有三种情况：
1、贷款买过一套房商业贷款未结清再次贷款买房认定为二套房;
2、个人名下有两套房的商业贷款记录，一套已还清另一套未还清再次贷款的认定为二套房;
3、夫妻双方，一方婚前使用商业贷款，另一方婚前使用公积金贷款，婚后想以夫妻名义共同贷款，贷款未还清的认定为二套房。
